福建师范大学生物博物馆建馆历史悠久，馆藏标本丰富。早在1907年福建优级师范学堂创立之初就设有博物专业，并开始收集动植物标本。1923年美国植物学家F. P. Metcalf博士创建了私立福建协和大学植物标本室。此后，福建省研究院动植物研究所植物标本室、福建华南女子文理学院植物标本室与私立福建协和大学三个植物标本室先后合并，组建了福建师范大学植物标本馆。经过林镕院士、周贞英教授、林来官教授等几代植物学家的不懈努力，馆藏植物标本数曾在全国高等院校中名列第六。该馆是全国高等师范院校及福建省馆藏植物标本数最多、规模最大的植物标本馆，保存了百余份极其珍贵的植物模式标本。1940年，在郑作新院士主持下，创建了私立福建协和大学动物标本室。经过郑作新院士、唐仲璋院士、唐崇惕院士和丁汉波教授等几代动物学家的艰辛努力，建成了福建师范大学动物标本馆。馆内动物标本种类齐全，侧重收藏本省的种类，许多动物标本系我国著名标本制作世家——唐家的杰作。2012年105周年校庆，福耀玻璃集团董事长曹德旺先生赠送了一只价值昂贵的北极熊标本。

博物馆所收藏的动植物标本为我国动植物区系研究、生物多样性保护、动植物资源的开发利用提供了重要的科学依据，在此基础上，本馆研究人员主编和参编了《中国动物志 》、《中国植物志》、《中国高等植物》、《中国高等植物图鉴》、《中国海藻志》、《中国淡水藻志》、《福建植物志》、《福建省棘头虫志》和《福建植被》等专著，为我国动植物学科的建设和发展做出了巨大贡献。

本馆为国内外学者提供宝贵的研究资料，也为社会各界人士宣传和普及生物科学知识提供了良好的参观学习基地。