方静平副教授

1. 个人简介

方静平，农学博士，福建师范大学生命科学学院副教授、硕士生导师。

• 社会兼职：

澳大利亚昆士兰大学（The University of Queensland，QS世界排名前50）客座高级研究员；

福建省高层次人才（C类）；

国家公派高级访问学者；

《Tropical Plants》期刊青年编委；

《Frontiers in Bioscience-Landmark》期刊青年编委；

《基因组学与应用生物学》期刊青年编委；

《福建师范大学学报（自然科学版）》期刊青年编委；

中国青年科技工作者协会会员；

福建省个人（团队）科技特派员；

2024年福州市茶科技科技特派员产业服务团副团长；

中国农技协、福建省科协福鼎栀子科技小院入驻专家；

福建仓山茉莉花茶科技小院入驻专家；

福建省工信厅入库专家；

福建省生物信息学学会会员；

国家自然科学青年基金函评专家；

多本SCI JCRQ1期刊审稿人；

• 科研简历：

长期致力于亚热带园艺植物及海洋微藻比较基因组学与功能基因组学研究，包括数据挖掘、分析流程开发和下游功能验证等基础研究。现已主持国家自然科学基金、省自然科学基金、省林业科技项目、省（市）级科技特派员、省教育厅基金等10余项，作为第二主要成员参与国家（部委）级项目和省面上基金5项。共参与发表学术论文60余篇。其中，近五年以第一或通讯作者（含同等贡献）已在《Nature Genetics》(IF 41.3,一区TOP)、《Plant Biotechnology Journal》（IF 13.3,一区TOP）、《Communications Biology》(一区TOP)、《Molecular Ecology Resources》(一区TOP)、《Industrial Crops and Products》(一区TOP)、《Journal of Integrative Agriculture》(一区TOP)、《LWT-Food Science and Technology》(一区TOP)等国内外著名刊物发表学术论文30余篇。

• 教学工作：

承担本科生《科技写作与文献检索》、《生物化学实验》、《食品生物技术》，博士生《生物信息学》等课程，参与《细胞生物学》国家和福建省一流本科课程和五类“金课”建设项目，国家级一流本科课程《细胞生物学》骨干成员。主持校级本科教育教学研究项目一项。

 2020-2021年校优秀班主任，2025-2026学年本科生投票评为“我最喜欢的好老师”。

• 招生方向：生物学、生物工程、生物技术与工程

研究方向为植物基因组学和生物信息学，欢迎具备生物学背景、计算机背景，或具有一定计算机编程基础的学生报考。分析项目需要对linux操作系统、python/perl语言、R语言具有一定的基础，熟悉awk/sed/grep命令（至少掌握一门编程语言，零基础可入学后培训），熟练使用Photoshop、Ai绘图软件进行图片排版。

学生指导：指导的硕士毕业生获省优秀硕士学位论文、校优秀硕士学位论文、国家奖学金、校优秀毕业生、校三好生、校一等奖学金等荣誉；指导多名本科生获校优秀毕业生称号。

• 主要教育与工作经历：

2. 研究方向和领域

★研究方向：

聚焦于亚热带园艺植物基因组学和生物信息学研究，主要包括：

(1)利用测序新技术和新算法辅助和改善高杂合复杂基因组组装和分型；

(2)基因组比较/核质转移机制/分子系统演化；

(3)重要农艺性状相关泛基因组结构变异的鉴定与功能基因组学解析；

(4)多组学联合分析挖掘植物关键功能基因并阐明其生物学机制；

(5)利用分子遗传标记辅助经济作物育种。

3. 主要科研项目

★主持项目：

 (1)球等鞭金藻（Isochrysis galbana）岩藻黄素合成途径关键基因挖掘及其对光质的响应机制研究，41906096，国家自然科学基金青年基金，2020/01-2022/12，主持，已结题；

 (2)基于基因组学的素馨属遗传多样性分析和高品质单瓣茉莉种质筛选，2025FKJ7，福建省林业科技项目，2025/01-2026/12，主持，在研；

 (3)茉莉花泛基因组结构变异鉴定及其对重要农艺品质的影响，2023J01508，福建省自然科学基金项目，2023/08-2026/08，主持，在研；

 (4)甘蔗割手密（S. spontaneum）全基因组微卫星标记的开发和多态性鉴定，2019J05066，福建省自然科学基金项目，2019/04-2022/04，主持，已结题；

(5)不同光质下球等鞭金藻（Isochrysis galbana）岩藻黄素生物合成的表达谱研究，JT180082，福建省教育厅项目(A类)，2018/10-2021/09，主持，已结题；

 (6)茉莉酸甲酯（MeJA）对茉莉花香气成分组成和含量的调控技术研究，2021-N-119，福州市科技计划项目（星火计划），2021/06-2023/06，主持，已结题；

 (7)甘蔗高贵种“中果”串联复制基因的基因组学特征研究，广西甘蔗生物学重点实验室开放课题，2020/07-2022/06，主持，已结题；

 (8) 2018-2019年，2023-2024年福建省科技特派员工作经费，主持；

(9) 2018-2026年福州市科技特派员工作经费，主持；

(10) 2022-2024年福建省科技特派员“茉莉花种质改良创新与绿色种植”团队，主持；2021-2022年福州市科技特派员“茉莉花种质资源创新和利用”团队，主持；

(11)福建师范大学高层次人才引进科研启动项目，主持；

(12)福建师范大学生命科学学院2021年“溪源江学者”扶持计划项目（科研骨干扶持项目），2022/01-2023/01，主持，已结题；

(13)福建师范大学生命科学学院2018年“溪源江学者”扶持计划项目（科研骨干扶持项目），2018/11-2019/11，主持，已结题；

★参与项目：

 (14)大肠杆菌持留菌耐药的遗传基础及杀灭新方法，2021J02029，福建省基金重点项目，2021/12-2024/12，排名第2，在研；

(15)糖料副产物综合利用，部委其他项目，2021/06-2024/06，排名第2，在研；

 (16)小球藻MBFJNU-1对高浓度游离氨的耐受机制：基于SRM1和bZIP60转录因子的调控网络分析，2025J01641，福建省自然科学基金面上项目，2025/10-2028/10，排名第3，在研；

(17)基于Y2H-seq技术的梅花花香调控生物标志物PmEOB1互作体解析，2022J01639，福建省自然科学基金面上项目，2022/08-2025/08，排名第3，在研；

(18)酶法制备新型EPA糖脂及其降脂功能的研究，2025N0009，省科技厅引导性项目（省级重点项目），2025/10-2028/10，排名第4，在研；

 (19)基于基因组学的藤壶综合防控技术研究，2022L3010，福建省科技厅引导性项目（省级重点项目），2022/08-2025/08，排名第6，在研；

 (20)漳港海蚌（西施舌）快长品系选育及商业化增养殖技术研发，2024F13，厅级重大，排名第5，在研；

 (21)福建师范大学生命科学学院科技创新团队培育计划，2023-2027，骨干成员，在研；

(22)螺旋藻固定燃煤电厂烟气CO2联产高附加值制品关键技术的研发，TZH2022-03，福建师范大学校管项目，2022/09-2024/09，排名第7，在研；

(23)蔗汁与糖蜜综合利用，部委其他项目，2017/01-2020/12，排名第2，已结题；

(24)不规则互作图可靠性及其在蛋白质相互作用网络中的应用，61702100，国家自然科学基金，2018/01-2020/12，排名第2，已结题；

(25)野生和栽培菠萝基因组结构变异的比较及其对重要农艺性状的影响，31701874，国家自然科学基金，2018/01-2020/12，排名第3，已结题；

 (26)番木瓜cpMYB24基因调控雄蕊发育的研究，2018J01601，福建省自然科学基金面上项目，2018/05-2021/04，排名第2，已结题；

 (27)文昌鱼性腺发育的分子机制，K20190281，福建省自然科学基金面上项目，2019/04-2022/04，排名第4，已结题；

(28)文昌鱼哈氏窝调控性腺周年变化的分子机制，JT180104，福建省教育厅项目，2018/10-2021/10，排名第4，已结题；

(29)几种贝类开发保健食品原料和精深加工技术研究，企事业单位委托科技项目，2018/05-2021/04，排名第4，已结题；

(30)虾蟹类加工副产物生产壳寡糖技术及产品开发，企事业单位委托科技项目，2018/04-2021/03，排名第5，已结题。

4. 代表性论著（第一或通讯，含共同）

[1] Fang J*, Dai J, Zhong C, et al. A modified phase extraction and separation method for sustainable co-production of fucoxanthin and docosahexaenoic acid from scale-cultured Isochrysis sp.[J]. LWT-Food Science and Technology 2026, 239: 118954. (中科院一区TOP, JCR Q1)

[2] Fang J*, Zhuang Y, Wang J, et al. Beyond the Single Reference: A Pangenomic Perspective on the Role of WRKY Transcription Factors in Ornamental Trait Diversity of Oleaceae [J].Annals of botany 2026. mcag044, https://doi.org/10.1093/aob/mcag044. (中科院二区TOP, JCR Q1)

 [3] Fang J*, Zhou L, Chen Q, Wang J, Zhuang Y, et al. Integrated multi-omics analysis unravels the floral scent characteristics and regulation in “Hutou” multi-petal jasmine[J]. Communications Biology 2025,8: 256. (中科院一区TOP, JCR Q1)

[4] Fan W, Liao Z, Gu M, Zhang Y, …, Fang J*, Ye N*, Wang P*. Pan-Genome of Jasminum sambac Reveals the Genetic Diversity of Different Petal Morphology and Aroma-Related Genes. Molecular Ecology Resources 2025, 9: e70013. (中科院一区TOP, JCR Q1)

 [5] Zhao K, Shen M, Zheng R, Tong T, …, Fang J*. A nearly complete genome assembly of multi-petal jasmine (Jasminum sambac) shed light into the flower variation and adaptability caused by chromosome variation from domestication[J]. Industrial Crops & Products 2025, 229: 120892. (中科院一区TOP, JCR Q1)

 [6] Feng L, Zhuang Y, Tian D, Zhou L, Wang J, Fang J*. Integrative Genomic and Cytogenetic Analyses Reveal the Landscape of Typical Tandem Repeats in Water Hyacinth[J]. Horticulturae 2025, 11: 657. (中科院二区, JCR Q1)

[7] Fang J*, Lin A, Yan H, Feng L, Lin S, et al. Cytoplasmic genomes of Jasminum sambac reveal divergent sub-mitogenomic conformations and a large nuclear chloroplast-derived insertion[J]. BMC Plant Biology 2024, 24: 861. (中科院二区TOP, JCR Q1)

 [8] Xu X, Huang H, Lin S, …, Henry R, Fang J*. Twelve newly assembled jasmine chloroplast genomes: unveiling genomic diversity, phylogenetic relationships and evolutionary patterns among Oleaceae and Jasminum species[J]. BMC Plant Biology 2024, 24:331. (中科院二区TOP, JCR Q1)

 [9] Fang J*^#(通讯及一作), Xu X^#, Chen Q^#, Lin A^#, Lei W, Lin S, Zhong C, Huang Y, He Y. The complete mitochondrial genome of Isochrysis galbana harbors a unique repeat structure and a specific trans-spliced cox1 gene[J]. Frontiers in Microbiology2022, 13:966219. (中科院二区TOP, JCR Q1)

[10] Yue J^#, VanBuren R^#, Liu J^#, Fang J^#(共一), Zhang X, Liao Z, Wai CM, Xu X, Chen S, Zhang S et al. SunUp and Sunset genomes revealed impact of particle bombardment mediated transformation and domestication history in papaya[J]. Nature Genetics 2022, 54: 715-724. (中科院一区TOP, JCR Q1)

 [11] Wang P^#, Fang J^#(共一), Lin H^#, Yang W, Yu J, Hong Y, Jiang M, Gu M, Chen Q, Zheng Y et al. Genomes of single- and double-petal jasmines (Jasminum sambac) provide insights into their divergence time and structural variations[J]. Plant Biotechnology Journal2022, 20(7): 1232-1234. (中科院一区TOP, JCR Q1)

 [12] Chen D^#, Yuan X^#, Zheng X^#, Fang J^#(共一), Lin G, Li R, Chen J, He W, Huang Z, Fan W et al. Multi-omics Analyses Provide Insight into the Biosynthesis Pathways of Fucoxanthin in Isochrysis galbana[J]. Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2022, 20(6): 1138-1153. (中科院一区TOP, JCR Q1)

 [13] Liu L, Wang H, Chen S, Cai M, Duo M, Li Y, Qi Y, Fang J*, Zhang J*. Genome-wide development of interspecific microsatellite markers for Saccharum officinarum and Saccharum spontaneum[J]. Journal of Integrative Agriculture2022, 21(11): 3230-3244. (中科院一区TOP, JCR Q1)

[14] Chen Q, Zhang X, Fang Y, Wang B, Xu S, Zhao K, Zhang J*, Fang J*. Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the R2R3-MYB Transcription Factor Family Revealed Their Potential Roles in the Flowering Process in Longan (Dimocarpus longan)[J]. Frontiers in Plant Science 2022, 13: 820439. (中科院二区TOP, JCR Q1)

[15] Lin E, Liao Z, Xu X, Zhang X, Fang J*. The complete chloroplast genome of the Chinese banyan tree Ficus macrocarpa[J]. Mitochondrial DNA Part B2022, 7(3): 423-425. (JCR Q4)

 [16] Fang J, Wood AM, Chen Y, Yue J, Ming R*. Genomic variation between PRSV resistant transgenic SunUp and its progenitor cultivar Sunset[J]. BMC Genomics2020, 21: 398. (中科院二区TOP, JCR Q1)

 [17] Fang J*, Lin A, Yuan X, Chen Y, He W, Huang J, Zhang X, Lin G, Zhang J, Xue T*. The complete chloroplast genome of Isochrysis galbana and comparison with related haptophyte species[J]. Algal Research 2020, 50: 101989. (中科院二区, JCR Q2)

 [18] Fang J, Lin A, Qiu W, Cai H, Umar M, Chen R, Ming R*. Transcriptome Profiling Revealed Stress-Induced and Disease Resistance Genes Up-Regulated in PRSV Resistant Transgenic Papaya[J]. Frontiers in Plant Science2016, 7: 855. (中科院二区TOP, JCR Q1)

 [19] Fang J, Wood A, Chen R, Ming R*. Molecular basis of off-type microsatellite markers in papaya[J]. Euphytica 2016, 209(2): 323-339. (JCR Q2)

 [20] Fang J, Miao C, Chen R, Ming R*. Genome-Wide Comparative Analysis of Microsatellites in Pineapple[J]. Tropical Plant Biology 2016, 9(3): 117-135. (JCR Q3)

 [21]林少青,周琳薇,冯丽卿,钟彩荣,曾瑜,方静平*.福州双瓣茉莉萜烯类合成酶基因家族鉴定及其响应茉莉酸甲酯的表达分析[J].生物工程学报, 2024, 40(10): 3561-3587.

[22] 周琳薇, 陈钦常, 林少青, 冯丽卿, 方静平*. 虎头茉莉萜烯类合成酶基因家族鉴定及其在开花进程中的表达分析[J]. 基因组与应用生物学, 2024, 43(11-12): 1687-1706.

[23] 廖毓森, 林少青, 陈钦常, 钟彩荣, 曾瑜, 方静平*. 外源茉莉酸甲酯对植物香气影响的研究进展[J]. 福建师范大学学报(自然科学版), 2023, 39(4): 46-56.

 [24] 钟彩荣, 陈钦常, 许涵玥, 曾子航, 徐绍丝, 车丹丹, 方静平*, 何勇锦*. 光质对等鞭金藻的生长和生物活性产物合成的影响[J]. 天然产物研究与开发, 2023, 35(10): 1775-1781.

[25] 林恩文, 林榕榕, 陈钦常, 徐秀明, 方静平*. 龙眼全基因组序列SSR位点的挖掘及特征分析[J]. 福建农林大学学报(自然科学版), 2022, 51(4): 493-501.

[26] 方静平*, 陈钦常, 黄鹭强. 岩藻黄素生物合成途径及其对光照响应研究进展[J]. 福建师范大学学报(自然科学版), 2021, 37(5): 96-108.

[27] 林哲寅, 方静平*. ISO22000体系在大型活动餐饮服务食品安全保障中的应用[J]. 食品安全质量检测学报, 2021, 12(15): 6240-6248.

[28] 方静平, 林艺华, 杨川毓等. 抗环斑病毒番木瓜的开发技术及转基因对基因组影响研究进展[J]. 福建农林大学学报(自然科学版), 2016, 45(2): 121-128.

[29] 方静平, 阙友雄, 陈如凯*. 甘蔗属起源及其与近缘属进化关系研究进展[J]. 热带作物学报, 2014, 35(4): 816-822.

[30] 方静平, 苏亚春, 游倩等. 甘蔗β-1,3-葡聚糖酶基因的电子克隆与分析[J]. 生物信息学, 2012, 10(3): 199-207.

授权专利：

[1] 方静平, 何勇锦, 钟彩荣, 王锦彬, 陈必链. 一种从淡水等鞭金藻FQZ-2中提取分离岩藻黄素、二十二碳六烯酸以及多糖的方法和装置. CN202411203110.8. 发明专利, 已申请;

[2] 陈钦常, 梁丽敏, 方静平, 黄鹭强. 一种微藻培养瓶. ZL202022749913.7. 实用新型专利, 已授权;

 [3] 叶传财, 林清强, 卢玉栋, 方静平, 黄瑞平, 阙玉林, 李爱萍, 等. 一种栀子花精油连续化生产提取纯化设备. ZL202510731098.6. 发明专利, 已授权;

 [4] 林璐遥, 方玉霖, 方静平, 林清强. 一种芳香类植物提取物用原料清洗装置. ZL202421409810.8. 实用新型专利, 已授权.

5. 联系方式