欧阳松应 教授

发布者:廖元春发布时间:2017-05-27浏览次数:11718


欧阳松应博士,教授,博士生导师,生命科学学院院长。生物学一级学科博士点带头人,校引进杰出人才,校学术委员会委员,校学科建设分委员会委员。

 

中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室客座研究员。


“闽江学者”特聘教授、北京市科技新星、福建省人力资源和社会保障厅2018年第一批省直中直单位引进创业创新领军人才(B类引进高层次人才)、中国科学院青年创新促进会会员、中国科学院卢嘉锡青年人才奖获得者、福建省高校新世纪优秀人才支持计划入选者、福建师范大学宝琛计划高端人才。

中国生物物理学会理事、中国免疫学会临床免疫分会第七届委员会委员、中国微生物学会医学微生物与免疫学专业委员会青年学组委员、中国微生物学会医学微生物与免疫学专业委员会噬菌体学组委员、中国医药生物技术协会生物诊断技术分会分子诊断技术专业学组委员、福建省药理学会常务理事、福建省生物工程学会理事。

 

     研究方向:病原体感染与宿主天然免疫反应分子机制研究

 

    办公电话:0591-22868199(Office),0591-22868072(Lab)

 

                                                    电子邮件(E-mail): ouyangsy@@fjnu.edu.cn, ouyangsy@@ibp.ac.cn(请删除一个@以防垃圾邮件)

 

                                                                                                                           通讯地址:福建福州闽侯县福建师范大学旗山校区理工楼11#南方生物医学研究中心412室(邮编:350117


一、简历 & 究工作摘要

        1997.07-2001.09 南昌大学 生物科学工程系 学士

        2001.08-2004.07 吉林大学和平校区(原解放军军需大学) 生物化学与分子生物学教研室 硕士

        2004.08-2007.06 北京协和医学院(清华大学)(原中国协和医科大学)基础医学院 生物化学与分子生物学系 博士

        2007.07-2010.08 中国科学院生物物理研究所 助理研究员

        2010.09-2013.11 中国科学院生物物理研究所 副研究员

        2013.12-2017.05 中国科学院生物物理研究所 研究员

 2015.12-2017.05 中国科学院生物物理研究所 博士生导师

 2017.06-   至今 中国科学院生物物理研究所 客座研究员

 2015.09-2016.09 美国UCLA微生物免疫分子遗传系 高级访问学者

       2017.06-   至今  福建师范大学生命科学学院/南方生物医学研究中心/福建省天然免疫生物学重点实验室/细胞逆境响应与代谢调控福建省高校重点实验室 教授、博导


       

Immunity, Nat Commun, PNAS(2), Cell Res(2), EMBO J, PLOS Pathog, JMCB, Structure, Acta Cryst D, J Cell Sci, J Virol, FASEB J, MCP, JMM国际知名杂志发表SCI学术论文30余篇,其中通讯或第一作者(含共同)共22篇。所发表论文总影响因子超过265,总引用次数超过1450次,单篇最高引用超过260次,引用次数超过120的有6篇,h-index 16。已申请专利2项,参编学术著作3部。主持或承担科技部、国家自然基金委、中国科学院、北京市科委、福建省教育厅等科研和人才项目超过20项。科研成果曾与我国“大亚湾中微子实验发现新的中微子振荡模式”和“iPSC研究新发现”等当年具有重要影响力的科研成果并列被中国科学院《2013科学发展报告》收录为“中国科学家代表性成果”,向全国人大、全国政协会议代表及国家领导人和有关部门领导提供,供高层科学决策参考,并在社会公开发行;被《中国科学院重大成果年报(2012)》收录,入选《中国科学院国际科技合作年度述评》2012年度报告的《国际科技合作重要进展》。

        曾为Cell Res , EMBO J, Nucleic Acids Research, Cancer Research, PNAS, Acta Cryst D, Journal of Molecular Cell Biology, Trends in Microbiology, Bioinformatics, Theranostics, Oncotarget, J Virol, Protein Cell, J Gen Virol, Science China: Life Science, 生物化学与生物物理进展,科学通报等杂志审稿人和国内国际基金项目评审人(如捷克科学基金会(Czech Science Foundation)项目评审人)、北京市自然基金会评专家。先后受邀做国际国内学术会议报告30余场次。


二、研究方向

        本实验室具备良好的的硬件条件、一流的科研平台和充足的科研经费,主要研究方向:运用X射线晶体学、冷冻电镜和其它生物物理技术研究病原体感染和宿主天然免疫反应的分子机制。

       1. 病毒感染、转录复制机制

       RNA病毒是引起人、畜、禽类、水产经济类动物重大传染性疾病的主要病原体。近年来,随着埃博拉病毒、寨卡病毒、中东呼吸道综合征冠状病毒、潜在大流行H5N1禽流感病毒等新发再发RNA病毒的出现,病毒感染性疾病带来的生物安全威胁日益受到广泛重视,已经成为公共卫生领域面临的全球性挑战。同时,新发再发病毒研究事关国家生物安全核心利益,一旦发生必须尽快为国家防控方案提供参考,对基于结构生物学方法解析这些病原体蛋白功能位点要求较高,既需要迅速反应、尽早获得可靠结论,还要求充分结合结构生物学和细胞生物学、病毒学、生物化学、合成生物学、抗体研发等交叉学科技术为潜在治疗药物研究打下基础。

      本课题组主要针对RNA病毒中具有代表性的布尼亚病毒等新发再发病毒为主要研究对象,今后的工作将继续夯实当前研究基础,以结构生物学和细胞生物学技术为主线,解析RNA病毒转录复制复合体的晶体结构,阐明病毒转录复制的分子机制,着重分析新发传染病病原体蛋白功能位点,同时阐明病毒转录复制调控及其与宿主相互作用的分子机制,发现RNA病毒转录复制机制的异同,探索干预RNA病毒转录复制的新机制和新手段,进一步拓展相关基础研究成果在生物医学和国防安全领域的应用。解析病毒转录复制及其与宿主相互作用复合体的精确三维结构,对于揭示病毒转录复制的分子机制和发现抗病毒新靶标具有关键的意义,既契合国家传染病防控的重大需求,也是当前蛋白质科学研究的国际前沿和热点。


        2. 宿主天然免疫反应的分子机制

       真核生物的天然免疫(又称固有免疫或非特异性免疫)反应(innate immune response),发生于系统发育的早期和抗感染应答的初期阶段,是机体抵抗病原微生物入侵、保护自身的第一道屏障。天然免疫系统一方面可以通过炎症反应等机制直接清除感染,另一方面还可以诱导获得性免疫(acquired immunity)系统的活化,进而激发更加高效和特异性的免疫应答,故天然免疫是免疫之本。天然免疫系统通过机体的模式识别受体(pattern-recognition receptors, PRRs)对入侵微生物中高度保守的“分子标签”(molecular signature)——病原相关分子模式(pathogen-associated molecular patternsPAMPs)进行特异性识别,从而感知病毒、细菌等外来微生物入侵并激活不同的胞内信号通路和基因表达,启动机体免疫反应。天然免疫如同机体的眼睛,监视与识别各种不同的疾病相关分子模式。因此,了解机体免疫系统对外源核酸、蛋白质以及分泌的小分子等的识别和检测的分子基础是天然免疫反应研究的重要内容。

  本课题组一直致力于天然免疫反应信号通路的结构与功能研究,已取得了一系列研究成果。病原微生物引发天然免疫反应尤其是STING介导的信号通路引起IIFN产生的研究正如火如荼,仍有许多科学问题亟待解决。课题组综合运用X-射线晶体学方法、Cryo-EM NMR和细胞生物学等技术致力于阐明病毒、病毒感染与与宿主天然免疫反应中胞内DNA感受因子识别、激活STING引起IIFN产生等生物过程中关键科学问题。


三、指导硕博研究生及博士后

    本课题组长期招收“071010生物化学与分子生物学”专业博士、硕士研究生,“071009细胞生物学”及“085238生物工程(专业学位)”硕士研究生,同时高薪吸纳博士后人员以及相关领域博士后。同时欢也欢迎有志从事科学研究工作的本科生到实验室交流学习。

    硕士研究生国家奖学金每生每年20000元;国家助学金每生每年6000元;学业奖学金:一、二、三等奖每生每年分别为10000元、6000元、3000元;“三助”中的“助教”、“助管”岗位津贴每生每月不低于500元,助研津贴由导师或课题组发放。此外,学校或学院对本校研究生推免或考取本校研究生给予奖励。

    学校开展优秀科研成果、优秀学位论文等项目评选活动,鼓励研究生参加高水平学术会议和到高水平大学、科研院所访学。同时,积极引入多种社会资金,对研究生的学习、生活进行奖励或资助。录取类别为定向就业的学生不享受国家奖学金、国家助学金。


   2016级硕士研究生叶维伟在第三届全国病毒学青年学者学术研讨会上获得Poster奖(二等)。


四、近期主要工作和进展

       Cas13b介导的CRISPR RNA成熟和识别的结构机制

20181113日,Nature旗下Cell Research杂志在线发表了本课题组最新研究成果,文章标题为“Structural insights into Cas13b-guided CRISPR RNA maturation and recognition”



该研究解析了Bergeyella zoohelcum(动物溃疡伯格菌)中Cas13bBzCas13b)与CRISPR RNA (crRNA) 二元复合物的晶体结构,揭示了precursor crRNApre-crRNA)成熟加工的酶活位点,阐明了crRNA成熟的分子机制;该研究成果对认识与理解细菌抵抗RNA病毒入侵的分子基础具有重要的意义,同时也为改造CRISPR-Cas13b系统,为其在RNA识别与编辑、核酸检测领域的应用提供了坚实的结构生物学基础。

本研究中,BzCas13b蛋白全长由1224个氨基酸残基构成,它包括了多个结构域。在课题组解析的其与crRNA二元复合物晶体结构中(分辨率为2.79 Å),我们发现BzCas13b的多结构域以LcrRNA为中心环绕分布,整体呈现出三角形空间结构,其Helical-1, HEPN-1 and HEPN-2结构域构成三角形结构的一边,RRI-1RRI-2结构域和linker region一起构成三角形结构的另一边,Helical-2结构域构成三角形结构的第三边。成熟的crRNA也包括了4个亚区域。结合结构生物学和体外生物化学等实验手段,课题组首次揭示了加工pre-crRNA的蛋白酶活位点,发现了pre-crRNA被加工的重要位点,校正了以往相关研究领域中不准确的研究内容,并且进一步阐明了crRNA的识别机制。另外,之前的相关研究表明,来自BzCas13b的两个HEPN结构域的氨基酸残基R116H121R1177H1182参与了靶RNA的切割,本研究内容证明了单个R116AR1177突变足以破坏该蛋白的靶RNA切割活性。


1Cell Research最新一期杂志封面



2BzCas13b蛋白全长三维晶体结构与关键酶活性功能位点解析



欧阳松应教授为本文的独立通讯作者,欧阳松应教授课题组的青年教师张博博士和研究生叶维伟为本文的共同第一作者,该研究得到国家自然科学基金和福建师范大学的经费资助,上海同步辐射光源(SSRFBL-17U1对该研究提供了重要的技术支持。 

据悉,Cell Research杂志是Nature旗下一个同行评议的国际期刊(月刊),发表生物-细胞生物学领域最新研究进展的原创性研究论文、权威综述、快报和述评的国际性期刊,最新影响因子:15.393I区。


论文链接:https://www.nature.com/articles/s41422-018-0109-4


五、代表性论文

1. Zhang B#, Ye W#, Ye Y, Zhou H, Saeed AFUH, Chen J, Lin J, Perčulija V, Chen Q, Chen CJ, Chang MX, Choudhary MI, Ouyang S*. Structural insights into Cas13b-guided CRISPR RNA maturation and recognition. Cell Res. 2018 Nov 13. doi: 10.1038/s41422-018-0109-4. (*独立通讯作者)

2. Zhen X, Zhou H, Ding W, Zhou B, Xu X, Perčulija V, Chen CJ, Chang MX, Choudhary MI, Ouyang S*. Structural basis of pheromone recognition by AimR among Spbeta group bacteriophages. Protein Cell. 2018 Nov 12. doi: 10.1007/s13238-018-0588-6. (*独立通讯作者)

3. Qu L, Jiang Y, Cheng C, Wu D, Meng B, Chen Z, Zhu Y, Shaw N, Ouyang S*, Liu ZJ*. Crystal structure of ATP-bound human ABCF1 demonstrates a new conformation of ABC proteins. Structure. 2018 Sep 4;26(9):1259-1265.e3.  (*共同通讯作者)

4. Li J#, Rodriguez J#, Niu F, Pu M, Wang J, Hung LW, Shao Q, Zhu Y, Ding W, Liu Y, Da Y, Yao Z, Yang J, Zhao Y, Wei GH, Cheng G, Liu ZJ, Ouyang S*. Structural basis for DNA recognition by STAT6. Proc Natl Acad Sci USA. 2016 Nov 15;113(46):13015-13020. (*独立通讯作者。This article is a PNAS Direct Submission)

    同行评价:

    1). 王璞玥*, 杨正宗, 杜生明. STAT6识别N4位点DNA的结构基础被揭示. SCIENTIA SINICA Vitae. 2017 Jan; 47(2), 240-243.

    2). Zhou X, Jiang Z*. N4 DNA Recognition by STAT6 – Structural and Functional Implications. Protein Cell. 2017 Apr;8(4):240-241.

5. Jiang Y, Zhu Y, Liu ZJ, Ouyang S*. The emerging roles of the DDX41 protein in immunity and diseases. Protein Cell. 2017 Feb;8(2):83-89. (*独立通讯作者)

6. Jiang Y, Zhu Y, Qiu W, Liu YJ, Cheng G, Liu ZJ*, Ouyang S*. Structural and functional analyses of human DDX41 DEAD domain. Protein Cell. 2017 Jan;8(1):72-76. (*共同通讯作者)

7. Chu Y#, Zhu Y#, Chen Y, Li W, Zhang Z, Liu D, Wang T, Ma J, Deng H, Liu ZJ, Ouyang S*, Huang L*. aKMT Catalyzes Extensive Protein Lysine Methylation in the Hyperthermophilic Archaeon Sulfolobus islandicus but is Dispensable for the Growth of the Organism. Mol Cell Proteomics. 2016 Sep;15(9):2908-23. (*共同通讯作者)

8.Wang L#, Valderramos SG#, Wu A, Ouyang S, Li C, Brasil P, Bonaldo M, Coates T, Nielsen-Saines K, Jiang T*, Aliyari R*, Cheng G*. From Mosquitos to Humans: Genetic Evolution of Zika Virus. Cell Host Microbe. 2016 Apr 14. pii: S1931-3128(16)30142-1. 

9. Jiang Y, Jiang H, Zhou S, Meng B, Liu ZJ*, Ouyang S*. Crystal structure of hGEF-H1 PH domain provides insight into incapability in phosphoinositide binding. Biochem Biophys Res Commun. 2016 Mar 18;471(4):621-7. (*共同通讯作者)

10. Ni X#, Ru H#, Ma F#, Zhao L#, Shaw N, Feng Y, Ding W, Gong W, Wang Q, Ouyang S*, Cheng G*, Liu ZJ*. New insights into the structural basis of DNA recognition by HINa and HINb domain of IFI16. J Mol Cell Biol. 2016 Jan 12;8 (1): 51-61. (*共同通讯作者,封面文章)

11. Liu B#, Ouyang S#, Makarova K, Xia Q, Zhu Y, Li Z, Guo L, Koonin E, Liu ZJ*, Huang L*. A primase subunit essential for efficient primer synthesis by an archaeal eukaryotic-type primase. Nat Commun. 2015 Jun 22;6:7300. (#共同第一作者)

12. Zhao L#, Hua T#, Crowley C, Ru H, Ni X, Shaw N, Jiao L, Ding W, Jiang Y, Hung LW, Liu L, Ye K, Ouyang S*, Cheng G*, Liu ZJ*. Structural analysis of asparaginyl endopeptidase reveals the activation mechanism and a reversible intermediate maturation stage. Cell Res. 2014 Mar; 24(3): 344-58. (*共同通讯作者)

13. Gu J, Feng Y, Feng X, Sun C, Lei L, Ding W, Niu F, Jiao L, Yang M, Li Y, Liu X, Song J, Cui Z, Han D, Du C, Yang Y, Ouyang S*, Liu ZJ*, Han W*. Structural and biochemical characterization reveals LysGH15 as an unprecedented “EF-hand-like” calcium-binding phage lysin. PLOS Pathogens. 2014 May 15;10(5):e1004109. (*共同通讯作者)

14. Meng B#, Wu D#*, Gu J, Ouyang S, Ding W, Liu ZJ*. Structural and functional analyses of human tryptophan 2,3-dioxygenase. 2014. PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics. 2014 Nov;82(11):3210-6.

15. Jiao L#, Ouyang S#, Shaw N, Song G, Feng Y, Niu F, Qiu W, Zhu H, Hung LW, Zuo X, Shtykova E, Zhu P, Dong YH, Xu R*, Liu ZJ*. Mechanism of the Rpn13-induced activation of Uch37. Protein Cell. 2014 Aug;5(8):616-30. (#共同第一作者)

16. Zhang L, Mo J, Swanson K, Wen H, Petrucelli A, Gregory S, Zhang Z, Schneider M, Jiang Y, Fitzgerald K, Ouyang S, Liu ZJ, Damania B, Shu HB, Duncan J, Ting J*. NLRC3, a member of the NLR family of proteins, is a negative regulator of innate immune signaling induced by the DNA sensor STING. Immunity. 2014 Mar 20; 40(3): 329-341.

    ·同行评价:

      Mangan M, Latz E*. NLRC3 Puts the Brakes on STING. Immunity. 2014 Mar 20; 40(3): 305-306.

17. Niu F, Ru H, Ding W, Ouyang S*, Liu ZJ*. Structural biology study of human TNF receptor associated factor 4 TRAF domain. Protein Cell. 2013, 4(9): 687-694. (*共同通讯作者,封面文章)

18. Niu F#, Shaw N#, Wang Y#, Jiao L#, Ding W, Upurd H, Ouyang S*, Cheng G*, Liu ZJ*. From the Cover: Structure of the Leanyer Orthobunyavirus Nucleoprotein-RNA complex reveals novel architecture for RNA encapsidation. Proc Natl Acad Sci USA. 2013 May 28;110(22):9054-9. (*共同通讯作者。This article is a PNAS Direct Submission)

    ·同行评价

    Zheng W, Tao YJ*. Genome encapsidation by orthobunyavirus nucleoproteins. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 110 (22) 8769-8770.

19. Jiao L#, Ouyang S#, Liang M#, Niu F#, Shaw N, Wu W, Ding W, Jin C, Peng Y, Zhu Y, Zhang F, Wang T, Li C, Zuo X, Luan CH, Li D, Liu ZJ*. Structure of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus nucleoprotein in complex with Suramin reveals therapeutic potentials. J Virol. 2013 Jun;87(12):6829-39. (#共同第一作者)

20. Shaw N, Ouyang S, Liu ZJ*. Binding of bacterial secondary messenger molecule c di-GMP is a STING operation. Protein Cell. 2013 Feb;4(2):117-29.

21. Parvatiyar K#, Zhang Z#, Teles RM, Ouyang S, Jiang Y, Iyer SS, Zaver SA, Schenk M, Zeng S, Zhong W, Liu ZJ, Modlin RL, Liu YJ*, Cheng G*. The helicase DDX41 recognizes the bacterial secondary messengers cyclic di-GMP and cyclic di-AMP to activate a type I interferon immune response. Nat Immunol. 2012 Nov 11; 13(8): 1155-1161. (封面文章)

    ·同行评价

    “News and Views”by Andrew G Bowie:Innate sensing of bacterial cyclic dinucleotides: more than just STING. Nat Immunol. 2012 Dec;13(12):1137-9.

22. Ouyang S#, Song X#, Wang Y#, Ru H#, Shaw N, Jiang Y, Niu F, Zhu Y, Qiu W, Parvatiyar K, Li Y, Zhang R, Cheng G*, Liu ZJ*. Structural Analysis of the STING Adaptor Protein Reveals a Hydrophobic Dimer Interface and Mode of Cyclic di-GMP Binding. Immunity. 2012 Jun; 36(6): 1073-1086. (#共同第一作者) (作为当年具有重要影响力的科研成果被中国科学院《2013科学发展报告》收录为“中国科学家代表性成果”;被《中国科学院重大成果年报(2012)》收录,入选《中国科学院国际科技合作年度述评》2012年度报告的《国际科技合作重要进展》)

23. Ouyang S#, Gong B#, Li JZ#, Zhao L#, Wu W, Zhang FS, Sun L, Wang SJ, Pan M, Li C, Liang W, Shaw N, Zheng J, Zhao GP, Wang Y*, Liu ZJ*, Liang M*. Structural insights into a human anti-IFN antibody exerting therapeutic potential for systemic lupus erythematosus. J Mol Med (Berl). 2012 July; 90(7):837-846. (#共同第一作者)

24. Zhan Z#, Ouyang S#, Liang W, Zhang Z, Liu ZJ*, Huang L*. Structural and functional characterization of the C-terminal catalytic domain of the SSV1 integrase. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2012 Jun; 68(Pt 6):659-70. (#共同第一作者)

25. Liang W#, Ouyang S#, Shaw N, Joachimiak A, Zhang R, Liu ZJ*. Conversion of D-ribulose 5-phosphate to D-xylulose 5-phosphate: new insights from structural and biochemical studies on human RPE. FASEB J. 2011 Feb; 25(2):497-504.(#共同第一作者)

26. Qiu XB#*, Ouyang S#, Li CJ, Miao S, Wang L, Goldberg AL*. hRpn13/ADRM1/GP110 is a novel proteasome subunit that binds the deubiquitinating enzyme, UCH37. EMBO J. 2006 Dec 13;25(24):5742-53. (#共同第一作者)

27. Yin XQ#, Ouyang S#, Xu WM*, Zhang XP, Fok K.L., Zhang JP, Miao SY, Chan HC*, Wang LF*. YWK-II as a novel Go protein-coupled receptor for Müllerian Inhibiting Substance in cell survival. J Cell Sci. 2007 May 1;120(Pt 9):1521-8. (#共同第一作者)

六、出版

1. Perčulija V, Ouyang S*. Diverse Roles of DEAD/DEAH-Box Helicases in Innate Immunity and Diseases. A chapter to HELICASES FROM ALL DOMAINS OF LIFE, edited by Dr. RENU TUTEJA, ICGEB, New Delhi. ISBN: 9780128146866. Elsevier出版社. 20189.*通讯作者)

2. 欧阳松应,刘志杰。重要天然免疫系统信号分子STING的结构与功能研究取得重要进展.2013科学发展报告》,科学出版社,ISBN: 978-7-03-036755-6/N.497

3. 参编《生物信息学方法指南》一书(科学出版社,ISBN 7-03-014465-120052月)。